МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ПРИРОДНЫХ И ДОМЕСТИЦИРОВАННЫХ АЗОВО-ЧЕРНОМОРСКИХ ПОПУЛЯЦИЙ СЕВРЮГИ ACIPENSER STELLATUS
Аннотация
На основании анализа пяти микросателлитных локусов (An20, AoxD161, AoxD165, Afug41, Afug51) определены особенности внутривидового полиморфизма природных и доместицированных популяций азово-черноморской севрюги. Показана значительная дивергенция рыб между разными группами ремонтно-маточных стад и между ремонтноматочными стадами и «дикими» рыбами, согласно выявленному распределению частот микросателлитных аллелей (p < 0,001). В то же время группы рыб из Азовского и Черного морей дифференцированы незначительно (Fst = 0,007). Очевидно, что внутривидовая популяционная структура азово-черноморской севрюги претерпела широкомасштабные изменения вследствие антропогенного влияния.
Об авторах
Н. Н. ТимошкинаРоссия
Ростов-на-Дону, 344002
Н. А. Небесихина
Россия
Ростов-на-Дону, 344002
Е. А. Иванова
Россия
Ростов-на-Дону, 344002
А. Г. Лепешков
Россия
Ростов-на-Дону, 344002
А. Е. Барминцева
Россия
Москва, 107140
Список литературы
1. Берг Л.С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. Ч.1. Л.; М.: Изд-во АН СССР, 1948. 514 с.
2. Макаров Э.В. Проблемы сохранения и восстановления популяций осетровых и перспективы развития осетроводства в Азовском бассейне: Автореф. дис. … докт. биол. наук. М.: АзНИИРХ, 2000. 70 с.
3. Мюге Н.С. , Барминцева А.Е., Расторгуев С.М. и др. Полиморфизм контрольного региона митохондриальной ДНК восьми видов осетровых и разработка системы ДНК-идентификации видов // Генетика. 2008. Т. 44. №7. С. 1–7.
4. Aljanabi Salah M., Martinez I. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques // Nucl. Acids Res. 1999. V. 25. № 22. P. 4692–4693.
5. Bacalbasa-Dobrovici N. Endangered migratory sturgeons of the lower Danube River and its delta // Environ. Biol. Fish. 1997. V. 48. P. 201–207.
6. Cornuet J.M., Luikart G. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data // Genetics. 1996. V. 144. №4. P. 2001–2014.
7. Earl D.A., Von Holdt B.M. Structure Harvester: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Cons. Genet. Res. 2012. V. 4. P. 359–361.
8. Henderson-Arzahola A., King T.L. Novel microsatellite markers fo Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) population delineation and broodstock management // Mol. Ecol. Notes. 2002. V. 2. P. 437–439.
9. Hensel K., Holcik J. Past and current status of sturgeons in the upper and middle Danube – Sturgeon Biodiversity and Conservation. Dordrecht: Kluwer Acad. Publ., 1997. Р. 185–200.
10. Nei M. Bottlenecks, genetic polymorphism and speciation // Genetics. 2005. V. 170. № 1. P. 1–4.
11. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update // Bioinformatics. 2012. V. 28. № 19. P. 2537–2539.
12. Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. 2000. V. 155. № 2. P. 945–959.
13. Raymakers С. CITES, the Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora: its role in the conservation of Acipenseriformes // J. Appl. Ichthyol. 2006. V. 22. Suppl. 1. P. 53–63.
14. Rousset F. Genepop’007: a complete reimplementation of the Genepop software for Windows and Linux // Mol. Ecol. 2008. № 8. P. 103–110.
15. Welsh A., May B. Development and standartization of disomic microsatellite markers for lake sturgeon genetic studies // J. Appl. Ichthyol. 2006. V. 22. P. 337– 344.
16. Zane L., Patarnello T., Ludwig А. et al. Isolation and characterization of microsatellites in the Adriatic sturgeon (Acipenser naccarii) // Mol. Ecol. Notes. 2002. V. 2. P. 586– 588.
Рецензия
Для цитирования:
Тимошкина Н.Н., Небесихина Н.А., Иванова Е.А., Лепешков А.Г., Барминцева А.Е. МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ПРИРОДНЫХ И ДОМЕСТИЦИРОВАННЫХ АЗОВО-ЧЕРНОМОРСКИХ ПОПУЛЯЦИЙ СЕВРЮГИ ACIPENSER STELLATUS. Вопросы рыболовства. 2018;19(4):491-499.
For citation:
Timoshkina N.N., Nebesikhina N.A., Ivanova E.A., Lepeshkov A.G., Barmintseva A.E. MICROSATELLITE POLYMORPHISM OF THE NATURAL AND DOMESTICATED AZOV AND BLACK SEA POPULATIONS OF STELLATE STURGEON ACIPENSER STELLATUS. Problems of Fisheries. 2018;19(4):491-499. (In Russ.)